Des richesses à exploiter

contexte

L’un des fondements de la médecine personnalisée est la compilation d’innombrables bases de données. Leur analyse soulève généralement toutes sortes de contraintes techniques, juridiques et éthiques, ainsi des aspects sémantiques liés au sens même de ces données. Une équipe de scientifiques de l’UNIGE et des HUG, en collaboration avec le SIB Institut Suisse de Bioinformatique et le CHUV, a élaboré une stratégie pour une infrastructure nationale, adoptée par l’ensemble des hôpitaux universitaires et des institutions académiques suisses. Cette stratégie s’appuie notamment sur un cadre sémantique commun, visant à utiliser les données de manière synergique et flexible selon les besoins de la recherche et les partenaires engagés. 

projet

Le projet est une mise en œuvre de cette stratégie et vise à améliorer l'utilisabilité et l'interprétabilité des données cliniques aux HUG. À terme, il a pour but de renforcer la capacité des chercheurs à interroger les données de manière autonome. Il est entièrement conforme aux normes locales et nationales et réunit des experts suisses de premier plan dans le domaine des nomenclatures en médecine, de la bioinformatique, des médecins, des codeurs professionnels, en plus des profils standards de la science des données. 

Ce projet est catalysé par le Centre de l'innovation des Hôpitaux universitaires de Genève.

Où en sommes-nous ?

Août 2025 : Les HUG ont franchi une étape majeure en rendant leurs données cliniques compréhensibles par les machines grâce à une grammaire sémantique unique. Plus de 100 000 éléments médicaux ont été encodés et reliés dans un graphe de connaissances regroupant plus d’un million de concepts et près de trois millions de relations.
Cette infrastructure permet d’interroger directement plus de 13 milliards de données cliniques avec une précision inédite. Des pipelines innovants de validation, de graphes et de traitement automatique du langage renforcent la fiabilité et la reproductibilité de l’approche. Ce projet place Genève à l’avant-garde mondiale de l’interopérabilité sémantique en santé.

chef de projet

Professeur Christian Lovis, Médecin-chef de service, Service des sciences de l'information médicale, Département diagnostique, Hôpitaux universitaires de Genève & Professeur ordinaire, Faculté de médecine, Département radiologie et informatique, Université de Genève